从Ｅ组出线的两支球队是切尔西和沙尔克04，切尔西是四胜两负积分十二分，而沙尔克04则是三胜一平两负积分十分。被淘汰的则是巴塞尔和布加勒斯特星。
从Ｆ组中出线的两支球队是多特蒙德和阿森纳队，这个小组情况比较特殊，排名前三的球队都是积分十二分，多特蒙德靠着净胜球压过阿森纳一头，获得第一。而阿森纳则是靠着净胜球压过了那不勒斯一头，位列第二。那不勒斯和马赛被淘汰。
从Ｇ组出线的两支球队是马德里竞技和圣彼得堡泽尼特，马德里竞技五胜一平保持不败，积分十六分。圣彼得堡泽尼特一胜三平两负积分六分，以一分优势胜出。另外被淘汰的两支球队都是同积五分，他们的是波尔图和奥地利维.也纳。
从Ｈ组出线的两支球队是巴塞罗那和AC米兰，巴塞罗那四胜一平一负积分十三分，AC米兰是两胜三平一负，积分九分。被淘汰的是阿贾克斯和凯尔特人队。
这样本赛季欧洲冠军联赛十六强的球队就已经产生了，小组排名第一的八支球队是曼彻斯特联队、皇家马德里队、巴黎圣日耳曼队、拜仁慕尼黑队、切尔西队、多特蒙德队、马德里竞技队和巴塞罗那队。
而排名小组第二的八支球队是勒沃库森队、加拉塔萨雷队、奥林匹亚科斯队、曼彻斯特城队、沙尔克04队、阿森纳队、圣彼得堡泽尼特队和AC米兰队。